In cooperation with the German Societies for Hygiene and Microbiology, Immunology and Virology, the Robert Koch Foundation annually awards three prizes for outstanding post-doctoral work to the next generation of scientists in these areas. The awards are endowed with 5,000 euros.
| 2020 | Petra Bacher (Kiel), Stephanie Pfänder (Bochum), Michael Sigal (Berlin) |
| 2019 | Henning Grüll (Köln), Anna Müller (Bonn), Daniel Utzschneider (Melbourne) |
| 2018 | Maximilian Münchhoff (Munich), Christian T. Mayer (New York), Christian Schwartz (Dublin), Lisa Maier (Heidelberg) |
| 2017 | Ahmed N. Hegazy (Berlin), Gisa Gerold (Hannover), Médéric Diard (Zürich) |
| 2016 | Jens Bernhard Bosse (Hamburg), Andreas Schlitzer (Bonn), Alexander J. Westermann (Würzburg) |
| 2015 | Meike Dittmann (New York, USA), Nishith Gupta (Berlin), Christoph Klose (Freiburg) |
| 2014 | Tim Lämmermann (Bethesda, USA), Benedikt B. Kaufer (Berlin), Kai Papenfort (Princeton, USA) |
| 2013 | Hanna-Mari Baldauf (Frankfurt am Main), Stefanie Eyerich (München), Luisa Fernanda Jimenez-Soto (München) |
| 2012 | Christine Goffinet (Ulm), Sandra Schwarz (USA), Christina Zielinski (Berlin) |
| 2011 | Cécilia Chassin (Hannover), Lars Dölken (München), Cynthia Sharma (Würzburg) |
| 2010 | Michael Schindler (Hamburg), Tanja Schneider (Bonn), Koji Tokoyoda (Japan) |
| 2009 | Michaela Ulrike Gack (USA), Olaf Groß (Schweiz), Bärbel Stecher (Schweiz) |
| 2008 | Bärbel Kaufmann (USA), Christoph Schoen (Würzburg), Astrid M. Westendorf (Essen) |
| 2007 | Melanie Brinkmann (USA), Ulrich Dobrindt (Würzburg), Florian Winau (Berlin) |
| 2006 | Jost Enninga (Frankreich), Jan Münch (Ulm), Ulrich Johannes Salzer (Freiburg) |
| 2005 | Volkhard Kempf (Tübingen), Anne Krug (München), Thomas Pietschmann (Heidelberg) |
| 2004 | Max Löhning (Schweiz), Christian Drosten (Hamburg), Mathias Hornef (Freiburg) |
| 2003 | Carsten Watzl (Heidelberg), Steffen Backert (Magdeburg), Wolfram Brune (Würzburg) |
| 2002 | Dirk Hans Busch (München), Christof Robert Hauck (Tübingen), Stefan Pöhlmann (Ulm) |
| 2001 | Ludger Klein (USA), Elke Mühlberger (Marburg), Gudula Schmidt (Freiburg) |
| 2000 | Steffen Stenger (Erlangen-Nürnberg), Henri-Jacques Delecluse (UK), Christof Dehio (Schweiz) |
| 1999 | Hans-Willi Mittrücker (Berlin), Matthias Dobbelstein (Marburg), Wolf-Dietrich Hardt (München) |
| 1998 | Harald Kropshofer (Heidelberg), Friedemann Weber (Freiburg), Sven Hammerschmidt (Braunschweig) |
